植物病害，特别是由真菌病原体引起的疾病，危害全球作物生物安全和预防它们需要快速检测和鉴定病原体。用于作物疾病诊断的传统方法依赖于可以通过眼睛识别疾病的病理学家的专业知识，但是这种方法具有许多限制，包括依赖于疾病症状的外观。

还值得注意的是，这种传统方法不允许在爆发期间快速识别未知病原体。这种限制最近在孟加拉国变得明显，当时小麦作物被南美种族的小麦爆炸真菌侵入而遭受破坏。

由于小麦是世界上最重要的作物之一，一群澳大利亚科学家希望通过开发一种分析小麦叶片样品中病原体DNA的新方法来解决这一局限。使用便携式DNA测序仪，他们能够实现小麦中病原体的早期和广泛检测 - 他们还能够表征小麦中的所有生物，并确认存在未被病理学家诊断出的意外疾病。

据该研究背后的科学家称，“现场和集中测序方法的结合将在未来彻底改变农业生物安全管理，减少作物损失。” 此外，这些方法可以纳入国家边境的常规野外疾病监测和生物安全监测，以节省时间和金钱，并防止像孟加拉国那样的另一次灾难性爆发。

在开放获取文章“使用便携式DNA测序仪对感染小麦进行病原体检测和微生物组分析”中讨论的这项研究也探讨了这种新策略可以识别疾病抑制微生物用于环境友好控制疾病的方式。该研究于2019年5月在线完成，最终发表于6月份的完全开放获取Phytobiomes期刊。